东莞有两所特殊学校：东莞启智学校和东莞市康复实验学校。
东莞启智学校是唯一一所由市教育局直接管理，以听障、轻中度智障儿童为教育对象的十二年制特殊教育公立学校。校园整洁美观，环境怡人，拥有设施先进完善的教学、康复训练和职业训练功能室。按照教育部颁发的特殊教育课程标准开设教学课程。
学校通过为智障学生提供三年的基础文化知识学习和职业技能训练，培养智障学生具备一般的职业认识和职业工作技能，增强他们平等参与社会劳动服务的能力和独立生活能力，成为适应社会发展、自食其力的社会劳动者。
东莞市康复实验学校是直属于东莞市残联管理的公益一类事业单位，于年2月经东莞市机编委批准成立，年9月1日正式开学，是一所综合性特殊教育学校。
坚持康教结合一体化，基础知识教学、生活技能训练与身心康复并重，为全市6-18岁智力残疾、脑性瘫痪、孤独症等类型学生提供义务教育、职业教育和康复教育等服务，提升他们的自尊心和自信心，让他们学会一技之长，真正独立于社会。
这两所学校共同为东莞市及周边地区的特殊儿童提供了全面的教育和康复支持，促进了这些学生的社会融入和个人发展。
东莞还有一些全封闭式的武术学校，例如少林武术学校、南城尚雅文武学校等，为学生提供全面的武术教育。这些学校注重武术技巧、素质培养和理论知识教育，为学生的身心发展提供支持。